Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BlmO88700 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BlmO88700 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BlmO88700 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BlmO88700 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BlmO88700 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BlmO88700 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BlmO88700 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms