Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme6O88425 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms