Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AvilO88398 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms