Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp4O70480 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms