Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtssO70370 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CtssO70370 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtssO70370 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtssO70370 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtssO70370 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms