Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms