Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms