Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr1O55100 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms