Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms