Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Atp10aO54827 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms