Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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