Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lhx8O35652 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lhx8O35652 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lhx8O35652 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lhx8O35652 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lhx8O35652 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms