Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RaxO35602 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RaxO35602 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RaxO35602 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RaxO35602 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RaxO35602 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms