Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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