Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk3O35492 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms