Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms