Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccrl2O35457 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms