Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms