Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf5O35326 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms