Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncoa3O09000 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncoa3O09000 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms