Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Barx2O08686 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Barx2O08686 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms