Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17078M0QW51 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17078M0QW51 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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