Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20878L7N244 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20878L7N244 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20878L7N244 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20878L7N244 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20878L7N244 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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