Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm21310J3QQ23 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm21310J3QQ23 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm21310J3QQ23 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21310J3QQ23 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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