Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms