Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms