Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC024978J3QPC3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms