Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms