Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms