Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms