Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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