Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms