Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms