Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms