Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf148G3X9R7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms