Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim55G3X8Y1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms