Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms