Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm28048F7BCN0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm28048F7BCN0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm28048F7BCN0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm28048F7BCN0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm28048F7BCN0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm28048F7BCN0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm28048F7BCN0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28048F7BCN0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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