Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms