Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms