Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms