Protein–RNA interactions for Protein: F6TJM2

Gm10065, Predicted gene 10065, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10065F6TJM2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10065F6TJM2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms