Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28374F6SG70 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28374F6SG70 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms