Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4E9QAP7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms