Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Simc1E9Q6E9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms