Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC005561E9Q5E2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC005561E9Q5E2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms