Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20518E9Q548 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20518E9Q548 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20518E9Q548 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20518E9Q548 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20518E9Q548 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20518E9Q548 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20518E9Q548 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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