Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r56E9Q4U5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms