Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3095E9Q058 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms