Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms